אילת מושכת מדי שנה רבבות צוללנים וחובבי צלילה סקרנים שמגיעים לגלות את הממלכה התת-ימית העשירה של הים האדום, השוכנת בסמוך לחופי אילת הקסומים.
אילת עומדת בשורה אחת עם אתרי הצלילה היפים ביותר, ועם המקומות הכי טובים בעולם לשנורקלינג. אתרים כמו קייפ קרי, ברקודה, החור הכחול, יולנדה ריף ועוד, מזכירים מאוד את חופיה של אילת, ובעיקר את מה שיש מתחת למים. מזג האוויר הנוח יחסית לאורך כל השנה, בשילוב עם המים הצלולים של הים האדום, יצרו אזור אידאלי לצוללנים מכל העולם שנמשכים ליופי הממגנט של העולם התת-ימי הקסום השוכן במרחק נגיעה מהחוף, עד כדי כך שניתן לראות את האלמוגים והדגים מציצים מהמים כבר מקו החוף.
אחד המקומות הטובים ביותר לצלילה באילת הוא חוף האלמוגים. רצועת החוף הדרומית נמתחת על פני קילומטר וחצי, והיא נחשבת לשמורת טבע מוגנת ולשונית האלמוגים הצפונית ביותר בעולם. מתחת למים מצפה למבקרים עולם תת-ימי מרהיב וצבעוני, עם אלמוגים, דגים ושאר יצורים מרתקים החיים מתחת למים. זהו מקום מושלם לצלילה ושנורקלינג, וגם לצילומים מתחת למים בשל מי הים הצלולים. הכניסה לחוף כרוכה בתשלום סמלי, ויש צורך בהזמנת צלילה מראש. יש אפשרות גם להשכיר ציוד שנורקלינג כמו משקפות, סנפירים ושנורקל.
עוד אתר צלילה מומלץ באילת הוא הגנים היפניים, 'גן חיות' תת-ימי השוכן בעומק הים, מול המצפה התת-ימי, ואליו ניתן להגיע באמצעות סירת צוללים. הצלילה עצמה יכולה להתרחש בשני אופנים: צלילה רדודה לעומק מקסימלי של 10 מטרים, וצלילה עמוקה לעומק מקסימלי של 30 מטרים. הצלילות מודרכות ומסודרות, לפי לו"ז סירה קבוע כדי למנוע עומס צוללנים באתר. חבל ארוך נמתח מנקודת העגינה של הסירה עד לקרקעית הרדודה, שעומקה 15 מטרים, ומשם פונים מזרחה לשיפוע, ואפשר לצלול עד לעומק של 30 מטרים. המתחם קיבל את שמו בשל הצמחייה הצבעונית העשירה שחיה מתחת למים, ומשמשת מקום אידאלי לצילומים. כדאי לבקר גם במסלול באתר הסטי"ל, שמאפשר צלילה לעומק של עד 24 מטרים, שבדרך מגלים ספינת טילים טרופה אשר הוטבעה במצולות.
מי שמחפש אתר שנורקלינג באילת ימצא את מבוקשו בספארי הימי המכונה 'שלוש האחיות', אתר צלילה רדוד, שעומקו שבעה מטרים לכל היותר, ונמצא דרומית לחוף המגדלור. מי שצולל עם שנורקל יכול ליהנות משפע עצום של דגים צבעוניים, בעוד צוללנים שיורדים עמוק יותר יעברו במסלול הצלילה שלהם נקודות מרתקות כמו סלעי אלמוגים חיים, אשר מלאים בדגי ריף נוצצים ודגי זכוכית. לא רחוק משם שוכן אתר "המערות", נקודת צלילה נוספת שאסור לפספס באילת. מי שצולל באתר מגלה ממלכה תת-ימית מרשימה עם מספר קשתות אלמוגים שחוצות את הריף ויוצרות מראה של מערות. בעבר היה ניתן לעבור דרך המערות, אך היום הן חסומות ברשתות על מנת לשמור על הריף ועל החיים בו.
בנוסף, יש מגוון בתי ספר בהם ניתן לקחת קורס צלילה באילת. מרבית בתי הספר מרוכזים ברצועת החוף הדרומית של אילת ובקרבת שונית האלמוגים, בין חוף הווילג' לחוף הנסיכה, שהוא החוף הדרומי ביותר באילת. בין מועדוני הצלילה המפורסמים של אילת ניתן למנות את מועדון אקווה סטאר, מועדון צלילה מנטה, לאקי דייברס, מרכז פלמידה ועוד.
במרבית החופים בעיר, וגם בחנויות המזכרות והדוכנים השונים ברחבי העיר והטיילת, ניתן להשכיר או לקנות ציוד שנורקלינג כמו משקפת, שנורקל וסנפירים, ולצאת לחקר עצמי במים הרדודים של אילת. החופים הטובים ביותר לשנורקלינג באילת הם חוף המגדלור, חוף הנסיכה וחוף קצא"א שברצועת החוף הדרומית, וחוף קיסוסקי, חוף השחפים וחוף תאילנד שברצועת החוף הצפונית.
חובבי צלילה רבים בוחרים לשלב לינה באילת עם צלילה בסיני, באתרי הצלילה המפורסמים והבתוליים שלחופי הים האדום. לשם כך הם יוצאים בשעות הבוקר וחוצים רגלית את מעבר הגבול טאבה, ומשם לוקחים טיולי יום לאורך רצועת החוף המצרית, לאתרי צלילה אהובים כמו 'בלו הול', ראס אבו גלום, ראס א-שטן, קאסל זמאן ועוד. לאחר יום של צלילה ושנורקלינג בחופי סיני, אפשר לחזור ללינה במלונות אילת ולבילוי לילי מהנה בעיר התוססת, שמלאה בפאבים, מסעדות, בתי קפה ומועדוני לילה.